MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50

Total Repeats: 1696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018651	AGC	2	6	3661	3666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485112
2	NC_018651	AGT	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485112
3	NC_018651	TCA	2	6	3895	3900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485113
4	NC_018651	CTG	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485113
5	NC_018651	CAGT	2	8	3944	3951	25 %	25 %	25 %	25 %	410485113
6	NC_018651	TCG	2	6	3964	3969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485113
7	NC_018651	GCC	2	6	4113	4118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410485113
8	NC_018651	T	7	7	4130	4136	0 %	100 %	0 %	0 %	410485113
9	NC_018651	AGG	2	6	4137	4142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410485113
10	NC_018651	ATT	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410485114
11	NC_018651	CAC	2	6	4326	4331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485114
12	NC_018651	T	6	6	4360	4365	0 %	100 %	0 %	0 %	410485114
13	NC_018651	CAT	2	6	4401	4406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485114
14	NC_018651	CAGT	2	8	4422	4429	25 %	25 %	25 %	25 %	410485114
15	NC_018651	TCA	3	9	4523	4531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485114
16	NC_018651	TGAAC	2	10	4542	4551	40 %	20 %	20 %	20 %	410485114
17	NC_018651	AC	3	6	4557	4562	50 %	0 %	0 %	50 %	410485114
18	NC_018651	CAT	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485114
19	NC_018651	GGT	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410485114
20	NC_018651	GGTAAT	2	12	4792	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485114
21	NC_018651	TTG	2	6	4843	4848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485114
22	NC_018651	ACC	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485114
23	NC_018651	CAC	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485114
24	NC_018651	T	6	6	4958	4963	0 %	100 %	0 %	0 %	410485114
25	NC_018651	TATT	2	8	5047	5054	25 %	75 %	0 %	0 %	410485115
26	NC_018651	AATA	2	8	5061	5068	75 %	25 %	0 %	0 %	410485115
27	NC_018651	CAT	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485115
28	NC_018651	TAA	2	6	5323	5328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485115
29	NC_018651	GTAA	2	8	5356	5363	50 %	25 %	25 %	0 %	410485115
30	NC_018651	TGTC	2	8	5374	5381	0 %	50 %	25 %	25 %	410485115
31	NC_018651	T	6	6	5460	5465	0 %	100 %	0 %	0 %	410485116
32	NC_018651	TGG	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410485116
33	NC_018651	TTC	2	6	5578	5583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485116
34	NC_018651	CTT	2	6	5717	5722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485116
35	NC_018651	TGT	2	6	5855	5860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485116
36	NC_018651	AT	3	6	5911	5916	50 %	50 %	0 %	0 %	410485116
37	NC_018651	GCG	2	6	5960	5965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410485117
38	NC_018651	CAT	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485117
39	NC_018651	AAC	2	6	6041	6046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485117
40	NC_018651	TA	3	6	6349	6354	50 %	50 %	0 %	0 %	410485118
41	NC_018651	TGC	2	6	6375	6380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485118
42	NC_018651	TGC	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485118
43	NC_018651	AAC	2	6	6511	6516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485118
44	NC_018651	CTT	2	6	6531	6536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485118
45	NC_018651	AGT	2	6	6540	6545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485118
46	NC_018651	ATCG	2	8	6796	6803	25 %	25 %	25 %	25 %	410485118
47	NC_018651	CAG	2	6	6868	6873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485118
48	NC_018651	ACAT	2	8	6875	6882	50 %	25 %	0 %	25 %	410485118
49	NC_018651	AG	3	6	6955	6960	50 %	0 %	50 %	0 %	410485118
50	NC_018651	CGACA	2	10	6976	6985	40 %	0 %	20 %	40 %	410485118
51	NC_018651	TACGA	2	10	7128	7137	40 %	20 %	20 %	20 %	410485118
52	NC_018651	TTC	2	6	7278	7283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485119
53	NC_018651	CAA	2	6	7364	7369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485119
54	NC_018651	GCA	2	6	7405	7410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485119
55	NC_018651	GC	3	6	7444	7449	0 %	0 %	50 %	50 %	410485119
56	NC_018651	CTG	2	6	7467	7472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485119
57	NC_018651	CA	3	6	7523	7528	50 %	0 %	0 %	50 %	410485119
58	NC_018651	AAT	2	6	7538	7543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485119
59	NC_018651	AG	3	6	7736	7741	50 %	0 %	50 %	0 %	410485120
60	NC_018651	GTAC	2	8	7760	7767	25 %	25 %	25 %	25 %	410485120
61	NC_018651	TCT	2	6	7850	7855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485120
62	NC_018651	GAC	2	6	7992	7997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485120
63	NC_018651	CAT	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485120
64	NC_018651	GCA	2	6	8043	8048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485120
65	NC_018651	CAT	2	6	8080	8085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485120
66	NC_018651	TCG	2	6	8126	8131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485120
67	NC_018651	TCT	2	6	8169	8174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485120
68	NC_018651	GTT	2	6	8324	8329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485120
69	NC_018651	TCAACG	2	12	8342	8353	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410485120
70	NC_018651	CCAG	2	8	8357	8364	25 %	0 %	25 %	50 %	410485120
71	NC_018651	TGC	2	6	8398	8403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485120
72	NC_018651	CGAT	2	8	8525	8532	25 %	25 %	25 %	25 %	410485120
73	NC_018651	ATT	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410485120
74	NC_018651	CTT	2	6	8583	8588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485120
75	NC_018651	TTC	2	6	8685	8690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485121
76	NC_018651	AACGGC	2	12	8808	8819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485121
77	NC_018651	TCA	2	6	8944	8949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485121
78	NC_018651	AG	4	8	8968	8975	50 %	0 %	50 %	0 %	410485121
79	NC_018651	GAAG	2	8	8981	8988	50 %	0 %	50 %	0 %	410485121
80	NC_018651	ATC	2	6	9093	9098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485121
81	NC_018651	T	6	6	9101	9106	0 %	100 %	0 %	0 %	410485121
82	NC_018651	CAC	2	6	9121	9126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485121
83	NC_018651	ACG	2	6	9155	9160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485121
84	NC_018651	CTCTTT	2	12	9254	9265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485121
85	NC_018651	CAG	2	6	9284	9289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485121
86	NC_018651	GCT	2	6	9373	9378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485121
87	NC_018651	TG	3	6	9408	9413	0 %	50 %	50 %	0 %	410485121
88	NC_018651	CAG	2	6	9427	9432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485121
89	NC_018651	CATC	2	8	9472	9479	25 %	25 %	0 %	50 %	410485121
90	NC_018651	ACG	2	6	9485	9490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485121
91	NC_018651	CAC	2	6	9607	9612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485122
92	NC_018651	TAAG	2	8	9618	9625	50 %	25 %	25 %	0 %	410485122
93	NC_018651	T	6	6	9657	9662	0 %	100 %	0 %	0 %	410485122
94	NC_018651	GGA	2	6	9663	9668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410485122
95	NC_018651	TCT	2	6	9727	9732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485122
96	NC_018651	GAC	2	6	9754	9759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485122
97	NC_018651	TCA	2	6	9810	9815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485122
98	NC_018651	CCAT	2	8	9883	9890	25 %	25 %	0 %	50 %	410485122
99	NC_018651	CAAG	2	8	9949	9956	50 %	0 %	25 %	25 %	410485122
100	NC_018651	TTCG	2	8	10029	10036	0 %	50 %	25 %	25 %	410485122
101	NC_018651	TGA	2	6	10093	10098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485122
102	NC_018651	TCA	2	6	10209	10214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485122
103	NC_018651	AAT	2	6	10268	10273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485122
104	NC_018651	ATC	2	6	10325	10330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485122
105	NC_018651	CCA	2	6	10458	10463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485122
106	NC_018651	CTT	2	6	10469	10474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485122
107	NC_018651	TCA	2	6	10563	10568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485122
108	NC_018651	CGT	3	9	10606	10614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485122
109	NC_018651	GTAGGC	2	12	10652	10663	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410485122
110	NC_018651	TCTT	2	8	10671	10678	0 %	75 %	0 %	25 %	410485122
111	NC_018651	CAC	2	6	10705	10710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485122
112	NC_018651	ACA	2	6	10725	10730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485122
113	NC_018651	GAC	2	6	10752	10757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485122
114	NC_018651	GGC	2	6	10769	10774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410485122
115	NC_018651	TCT	2	6	10866	10871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485122
116	NC_018651	TGA	2	6	10888	10893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485122
117	NC_018651	ACC	2	6	10899	10904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485122
118	NC_018651	ACCA	2	8	10996	11003	50 %	0 %	0 %	50 %	410485122
119	NC_018651	CGCC	2	8	11004	11011	0 %	0 %	25 %	75 %	410485122
120	NC_018651	T	6	6	11045	11050	0 %	100 %	0 %	0 %	410485122
121	NC_018651	CCA	2	6	11077	11082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485122
122	NC_018651	TTTG	2	8	11092	11099	0 %	75 %	25 %	0 %	410485122
123	NC_018651	ACC	2	6	11149	11154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485123
124	NC_018651	AATC	2	8	11283	11290	50 %	25 %	0 %	25 %	410485123
125	NC_018651	AAT	2	6	11397	11402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485123
126	NC_018651	TC	3	6	11524	11529	0 %	50 %	0 %	50 %	410485123
127	NC_018651	TCA	2	6	11534	11539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485123
128	NC_018651	TCA	2	6	11576	11581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485123
129	NC_018651	GTA	2	6	11719	11724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485123
130	NC_018651	AGC	2	6	11797	11802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485123
131	NC_018651	CCG	2	6	11811	11816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410485123
132	NC_018651	CTTT	2	8	11869	11876	0 %	75 %	0 %	25 %	410485123
133	NC_018651	CCG	2	6	11954	11959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410485123
134	NC_018651	TCA	2	6	12023	12028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485123
135	NC_018651	CGC	2	6	12051	12056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410485123
136	NC_018651	TTC	2	6	12104	12109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485123
137	NC_018651	GTG	2	6	12125	12130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410485123
138	NC_018651	T	7	7	12236	12242	0 %	100 %	0 %	0 %	410485123
139	NC_018651	GCC	2	6	12248	12253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410485123
140	NC_018651	AAT	2	6	12259	12264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485123
141	NC_018651	AAC	2	6	12310	12315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485123
142	NC_018651	ATT	2	6	12395	12400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410485123
143	NC_018651	TCC	2	6	12403	12408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410485124
144	NC_018651	CAT	2	6	12419	12424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485124
145	NC_018651	CTT	3	9	12449	12457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485124
146	NC_018651	GAT	2	6	12483	12488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485124
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148	NC_018651	TTC	2	6	12564	12569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485124
149	NC_018651	CT	3	6	12644	12649	0 %	50 %	0 %	50 %	410485124
150	NC_018651	GA	3	6	12660	12665	50 %	0 %	50 %	0 %	410485124
151	NC_018651	ACCATC	2	12	12718	12729	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410485124
152	NC_018651	ACG	2	6	12765	12770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485124
153	NC_018651	TTC	2	6	12771	12776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485124
154	NC_018651	ACG	2	6	12903	12908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485124
155	NC_018651	TCC	2	6	12922	12927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410485124
156	NC_018651	CGG	2	6	13279	13284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410485125
157	NC_018651	CCA	2	6	13325	13330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485125
158	NC_018651	T	6	6	13336	13341	0 %	100 %	0 %	0 %	410485125
159	NC_018651	TGA	2	6	13457	13462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485125
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164	NC_018651	CCA	2	6	13676	13681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485126
165	NC_018651	TCG	2	6	13703	13708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485126
166	NC_018651	CCA	2	6	13760	13765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485126
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169	NC_018651	CGGAA	2	10	13844	13853	40 %	0 %	40 %	20 %	410485126
170	NC_018651	GTT	2	6	14076	14081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485126
171	NC_018651	GGT	2	6	14115	14120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410485126
172	NC_018651	TGGT	2	8	14126	14133	0 %	50 %	50 %	0 %	410485126
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251	NC_018651	ACACC	2	10	17963	17972	40 %	0 %	0 %	60 %	410485130
252	NC_018651	GAAAA	2	10	18048	18057	80 %	0 %	20 %	0 %	410485131
253	NC_018651	A	7	7	18132	18138	100 %	0 %	0 %	0 %	410485131
254	NC_018651	A	7	7	18281	18287	100 %	0 %	0 %	0 %	410485131
255	NC_018651	CAT	2	6	18382	18387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485132
256	NC_018651	TTG	2	6	18411	18416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485132
257	NC_018651	TTCT	2	8	18442	18449	0 %	75 %	0 %	25 %	410485132
258	NC_018651	TTG	2	6	18477	18482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485132
259	NC_018651	TGC	2	6	18490	18495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485132
260	NC_018651	TGAAA	2	10	18529	18538	60 %	20 %	20 %	0 %	410485132
261	NC_018651	TAT	2	6	18588	18593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410485132
262	NC_018651	T	6	6	18614	18619	0 %	100 %	0 %	0 %	410485132
263	NC_018651	CA	3	6	18633	18638	50 %	0 %	0 %	50 %	410485132
264	NC_018651	TGC	2	6	18649	18654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485132
265	NC_018651	TATC	2	8	18668	18675	25 %	50 %	0 %	25 %	410485132
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268	NC_018651	AT	3	6	18744	18749	50 %	50 %	0 %	0 %	410485132
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273	NC_018651	A	6	6	18902	18907	100 %	0 %	0 %	0 %	410485132
274	NC_018651	ATT	2	6	18937	18942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410485132
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285	NC_018651	A	6	6	19690	19695	100 %	0 %	0 %	0 %	410485134
286	NC_018651	GTA	2	6	19722	19727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485134
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289	NC_018651	AAAG	2	8	19809	19816	75 %	0 %	25 %	0 %	410485134
290	NC_018651	TGA	2	6	19931	19936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485134
291	NC_018651	ACA	2	6	19944	19949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485134
292	NC_018651	TTAC	2	8	19993	20000	25 %	50 %	0 %	25 %	410485134
293	NC_018651	TCGT	2	8	20065	20072	0 %	50 %	25 %	25 %	410485134
294	NC_018651	A	7	7	20109	20115	100 %	0 %	0 %	0 %	410485134
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300	NC_018651	GTC	2	6	20553	20558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485135
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323	NC_018651	ACG	2	6	22095	22100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485138
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379	NC_018651	CTT	3	9	28388	28396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485147
380	NC_018651	CCA	2	6	28406	28411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485147
381	NC_018651	TCAG	2	8	28537	28544	25 %	25 %	25 %	25 %	410485147
382	NC_018651	TCA	2	6	28571	28576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485147
383	NC_018651	CCA	2	6	28646	28651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485147
384	NC_018651	TTG	2	6	28831	28836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485147
385	NC_018651	ATC	2	6	28929	28934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485147
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387	NC_018651	GTA	3	9	28959	28967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485147
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392	NC_018651	TCTT	2	8	29185	29192	0 %	75 %	0 %	25 %	410485147
393	NC_018651	TCG	2	6	29200	29205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485147
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395	NC_018651	CCAG	2	8	29273	29280	25 %	0 %	25 %	50 %	410485147
396	NC_018651	AGA	2	6	29462	29467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410485147
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498	NC_018651	CA	3	6	35296	35301	50 %	0 %	0 %	50 %	410485157
499	NC_018651	CA	3	6	35304	35309	50 %	0 %	0 %	50 %	410485157
500	NC_018651	TCG	2	6	35311	35316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485157

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